Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcaP82350 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcaP82350 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcaP82350 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcaP82350 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcaP82350 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SgcaP82350 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
SgcaP82350 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms