Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms