Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms