Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPAP53621 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPAP53621 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPAP53621 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPAP53621 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPAP53621 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPAP53621 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPAP53621 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPAP53621 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms