Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACLYP53396 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACLYP53396 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACLYP53396 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACLYP53396 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACLYP53396 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACLYP53396 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACLYP53396 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACLYP53396 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACLYP53396 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACLYP53396 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACLYP53396 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms