Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPFP49454 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPFP49454 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPFP49454 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPFP49454 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPFP49454 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPFP49454 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPFP49454 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPFP49454 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPFP49454 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms