Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms