Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT2P45379 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNT2P45379 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNT2P45379 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms