Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF4P43489 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF4P43489 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms