Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CAP42336 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CAP42336 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms