Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms