Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 PRM4YPL156C 855 nt2.89□□□□□ -1.95
SOP4P39543 NIP7YPL211W 546 nt2.89□□□□□ -1.95
SOP4P39543 NOP4YPL043W 2058 nt2.89□□□□□ -1.95
SOP4P39543 DUF1YOL087C 3351 nt2.89□□□□□ -1.95
SOP4P39543 CCT7YJL111W 1653 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 SMC2YFR031C 3513 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 RRP42YDL111C 798 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YDR535CYDR535C 501 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 PAN5YHR063C 1140 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 PKP2YGL059W 1476 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 PMR1YGL167C 2853 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 SST2YLR452C 2097 nt2.88□□□□□ -1.95
SOP4P39543 PUF6YDR496C 1971 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YNR063WYNR063W 1824 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 DYN2YDR424C 279 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 SPT2YER161C 1002 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YGL138CYGL138C 1038 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YGR168CYGR168C 1131 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 HHF1YBR009C 312 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YHR080CYHR080C 4038 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 NDT80YHR124W 1884 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 FRE2YKL220C 2136 nt2.87□□□□□ -1.95
SOP4P39543 EXO70YJL085W 1872 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 MSB2YGR014W 3921 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 TFC4YGR047C 3078 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 BSC1YDL037C 987 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 RAD55YDR076W 1221 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 GRX2YDR513W 432 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 APA2YDR530C 978 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 ARI1YGL157W 1044 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 SWD2YKL018W 990 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 SDH3YKL141W 597 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YLR416CYLR416C 399 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 BAG7YOR134W 1230 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YPL107WYPL107W 747 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 ATG29YPL166W 642 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 KRE2YDR483W 1329 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 COM2YER130C 1332 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 RRP14YKL082C 1305 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 ERG11YHR007C 1593 nt2.86□□□□□ -1.95
SOP4P39543 LRG1YDL240W 3054 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 RPL1BYGL135W 654 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 MPC3YGR243W 441 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YHR097CYHR097C 1101 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YIL161WYIL161W 708 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YLR230WYLR230W 306 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 BUD21YOR078W 645 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 RPL1AYPL220W 654 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 HRD1YOL013C 1656 nt2.85□□□□□ -1.95
SOP4P39543 SPH1YLR313C 1593 nt2.84□□□□□ -1.95
SOP4P39543 YDR124WYDR124W 975 nt2.84□□□□□ -1.95
SOP4P39543 QCR10YHR001W-A 234 nt2.84□□□□□ -1.95
SOP4P39543 PFS1YHR185C 714 nt2.84□□□□□ -1.95
SOP4P39543 snR11snR11 258 nt2.84□□□□□ -1.95
SOP4P39543 MTL1YGR023W 1656 nt2.84□□□□□ -1.95
SOP4P39543 ITT1YML068W 1395 nt2.84□□□□□ -1.96
SOP4P39543 WHI3YNL197C 1986 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SNU23YDL098C 585 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SMT3YDR510W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SPT15YER148W 723 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 IME1YJR094C 1083 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 ATG34YOL083W 1239 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 ICS2YBR157C 768 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 CSH1YBR161W 1131 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YNR066CYNR066C 1311 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 MYO5YMR109W 3660 nt2.83□□□□□ -1.96
SOP4P39543 STT4YLR305C 5703 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 CDC26YFR036W 375 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 ARG3YJL088W 1017 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 GLG2YJL137C 1143 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 IMP4YNL075W 873 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 MCT1YOR221C 1083 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 TFB6YOR352W 1032 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YPR053CYPR053C 456 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 UBS1YBR165W 834 nt2.82□□□□□ -1.96
SOP4P39543 RAX2YLR084C 3663 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 HTA1YDR225W 399 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YBL028CYBL028C 321 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 PNO1YOR145C 825 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YDR131CYDR131C 1671 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 NTO1YPR031W 2247 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YOR296WYOR296W 3870 nt2.81□□□□□ -1.96
SOP4P39543 REG1YDR028C 3045 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 AKR1YDR264C 2295 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 TOM70YNL121C 1854 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 CEP3YMR168C 1827 nt2.8□□□□□ -1.96
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