Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TtlP38585 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtlP38585 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtlP38585 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtlP38585 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtlP38585 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TtlP38585 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TtlP38585 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtlP38585 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtlP38585 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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