Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARGP37231 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGP37231 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPARGP37231 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGP37231 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGP37231 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGP37231 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGP37231 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGP37231 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms