Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	VMA21	YGR105W	234 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YGR126W	YGR126W	693 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	RIM4	YHL024W	2142 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	QCR10	YHR001W-A	234 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	TPK3	YKL166C	1197 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	BET5	YML077W	480 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	GIM5	YML094W	492 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	SEC14	YMR079W	915 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	GAL7	YBR018C	1101 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	NIP7	YPL211W	546 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	RRN7	YJL025W	1545 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YLR446W	YLR446W	1302 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YPR003C	YPR003C	2265 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	UBX3	YDL091C	1368 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YEH2	YLR020C	1617 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	SWI3	YJL176C	2478 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	GOS1	YHL031C	672 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	GIC1	YHR061C	945 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	ATG10	YLL042C	504 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	COQ9	YLR201C	783 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	NKP2	YLR315W	462 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	PRM6	YML047C	1059 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	RPL15B	YMR121C	615 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YOR203W	YOR203W	354 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	FSH3	YOR280C	801 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	BUD27	YFL023W	2391 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	TRM82	YDR165W	1335 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	NTA1	YJR062C	1374 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	NOP8	YOL144W	1455 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	VPS33	YLR396C	2076 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	STP1	YDR463W	1560 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YDL094C	YDL094C	510 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	SLU7	YDR088C	1149 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	LRS4	YDR439W	1044 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	THO1	YER063W	657 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YFL015C	YFL015C	495 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YJL114W	YJL114W	681 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	NYV1	YLR093C	762 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	BUR2	YLR226W	1188 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	GMC2	YLR445W	567 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	RUF22	RUF22	515 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	ATP19	YOL077W-A	207 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	UTP23	YOR004W	765 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	snR17a	snR17a	333 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	TSR1	YDL060W	2367 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	PRP31	YGR091W	1485 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	SMI1	YGR229C	1518 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YMR221C	YMR221C	1515 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	PEA2	YER149C	1263 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	ECI1	YLR284C	843 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	PTA1	YAL043C	2358 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	SRP72	YPL210C	1923 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	GAD1	YMR250W	1758 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YCR013C	YCR013C	648 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YDL163W	YDL163W	303 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	PHM6	YDR281C	315 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	UPF3	YGR072W	1164 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	AIM25	YJR100C	984 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	MRPL39	YML009C	213 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	MRPS9	YBR146W	837 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SIP1	P32578	UTP25	YIL091C	2166 nt		3.59	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	PGS1	YCL004W	1566 nt		3.59	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	PRM15	YMR278W	1869 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	BRE4	YDL231C	3378 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	DSE2	YHR143W	978 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	IME1	YJR094C	1083 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YET1	YKL065C	621 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	VMA5	YKL080W	1179 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YRO2	YBR054W	1035 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YPR170C	YPR170C	336 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	VPS9	YML097C	1356 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YCT1	YLL055W	1596 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	AEP1	YMR064W	1557 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	EXO70	YJL085W	1872 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YCR108C	YCR108C	192 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	YDL016C	YDL016C	303 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SIP1	P32578	BSC1	YDL037C	987 nt		3.57	□□□□□ -1.84

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