Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRS3P32247 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRS3P32247 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRS3P32247 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRS3P32247 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRS3P32247 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRS3P32247 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRS3P32247 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRS3P32247 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRS3P32247 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRS3P32247 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRS3P32247 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRS3P32247 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRS3P32247 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms