Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3AP31941 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms