Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR2P28476 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR2P28476 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms