Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms