Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM21P19474 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms