Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD58P19256 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD58P19256 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD58P19256 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD58P19256 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD58P19256 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms