Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18529 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18529 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18529 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18529 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18529 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18529 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms