Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VCLP18206 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VCLP18206 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VCLP18206 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCLP18206 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VCLP18206 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCLP18206 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCLP18206 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCLP18206 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCLP18206 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCLP18206 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms