Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms