Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2P10911 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2P10911 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2P10911 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2P10911 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2P10911 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2P10911 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2P10911 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2P10911 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2P10911 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms