Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX58O95786 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX58O95786 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX58O95786 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX58O95786 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX58O95786 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX58O95786 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX58O95786 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX58O95786 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX58O95786 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX58O95786 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX58O95786 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX58O95786 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX58O95786 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX58O95786 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms