Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRP6O75581 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRP6O75581 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRP6O75581 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRP6O75581 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRP6O75581 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRP6O75581 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRP6O75581 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP6O75581 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP6O75581 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP6O75581 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP6O75581 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms