Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms