Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP9BO43861 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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