Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMINO43313 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMINO43313 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMINO43313 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMINO43313 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms