Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPNA3O00505 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KPNA3O00505 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KPNA3O00505 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPNA3O00505 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPNA3O00505 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPNA3O00505 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPNA3O00505 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KPNA3O00505 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPNA3O00505 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPNA3O00505 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms