Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C1D1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C1D1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H7C1D1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
H7C1D1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1D1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1D1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1D1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1D1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1D1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1D1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1D1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1D1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1D1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1D1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms