Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H7C0C1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C0C1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C0C1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C0C1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C0C1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C0C1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C0C1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C0C1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C0C1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C0C1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C0C1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C0C1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H7C0C1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms