Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc17E9PVB5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc17E9PVB5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms