Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms