Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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