Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms