Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms