Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms