Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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