Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAL4Q9UM19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms