Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms