Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX41Q9UJV9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms