Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL4Q9UJQ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL4Q9UJQ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms