Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q9UJK0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSR3Q9UJK0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSR3Q9UJK0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSR3Q9UJK0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSR3Q9UJK0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSR3Q9UJK0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms