Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA3Q9UI47 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms