Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNAL1Q9UBT7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms