Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms