Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK4Q9NYG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK4Q9NYG8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms