Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms